Fisher Kesin Testi Hesaplama
Fisher kesin testi, 2×2 çapraz tablodaki iki değişkenin bağımsız olup olmadığını yaklaşık bir dağılıma başvurmadan, doğrudan olasılık hesabıyla sınar. Satır ve sütun toplamları sabit tutulduğunda tablonun alabileceği bütün biçimlerin hipergeometrik olasılıkları tek tek hesaplanır ve gözlenen tablo kadar ya da ondan daha uç olan tabloların olasılıkları toplanır.
Ki-kare testi χ² dağılımına dayanan bir YAKLAŞIMDIR ve beklenen frekanslar küçüldükçe bozulur; Fisher testi ise her örneklem büyüklüğünde geçerlidir. Bu araç kesin p değerinin yanında gözlenen tablonun olasılığını, tek kuyruk p değerlerini, odds oranını güven aralığıyla ve aynı tablonun ki-kare (Pearson ve Yates) sonuçlarını yan yana vererek küçük örneklemde neden Fisher gerektiğini sayılarla gösterir.
Fisher Kesin Testi Formülleri
Tablo: [a b; c d], N = a + b + c + d Hipergeometrik: P(A = i) = C(a+b, i) · C(c+d, a+c−i) / C(N, a+c) Destek: max(0, (a+c) − (c+d)) ≤ i ≤ min(a+b, a+c) Çift kuyruk: p = Σ P(A = i), P(A = i) ≤ P(gözlenen) olan tüm i için Sol kuyruk: p = P(A ≤ a) Sağ kuyruk: p = P(A ≥ a) Odds oranı: OR = (a·d) / (b·c) SE(ln OR): √(1/a + 1/b + 1/c + 1/d) OR güven aralığı: exp(ln OR ± z · SE)
Çift kuyruklu p, "gözlenen tablodan daha olası olmayan tüm tablolar" (minimum olabilirlik / Irwin) yöntemiyle hesaplanır; R'nin fisher.test uygulamasıyla aynıdır. Tek kuyruklu p değerlerinin iki katını almak, tablo simetrik değilse yanlış sonuç verir.
Nasıl Hesaplanır?
- 2×2 tablonuzun dört hücresini girin: a ve b birinci grubun, c ve d ikinci grubun sonuç var/yok sayılarıdır.
- Odds oranı için güven düzeyini, karar için anlamlılık düzeyini seçin.
- Çift kuyruklu kesin p değerini okuyun; yön hipoteziniz önceden belirlenmişse ilgili tek kuyruk değerini kullanın.
- Ki-kare karşılaştırma satırlarına bakın: en küçük beklenen frekans 5'in altındaysa Pearson χ² p değeri güvenilmezdir, kesin p esas alınmalıdır.
- Odds oranını ve güven aralığını birlikte raporlayın; aralık 1'i içeriyorsa etki istatistiksel olarak anlamlı değildir.
- Hipergeometrik dağılım grafiğinde koyu çubuklar çift kuyruklu p'ye giren tabloları gösterir; bu, p değerinin nasıl oluştuğunu görsel olarak açıklar.
Örnek Hesaplamalar
Küçük örneklemde belirgin fark
İki grupta 10'ar denek var; birinci grupta 1, ikinci grupta 8 kişide sonuç görülmüş. Fisher kesin çift kuyruklu p = 0,005 ile fark anlamlıdır; sol kuyruk p = 0,003 ve gözlenen tablonun olasılığı 0,00268'dir. Odds oranı 0,028 (%95 GA: 0,002 – 0,367). En küçük beklenen frekans 4,50 olduğu için ki-kare yaklaşımı koşulu sağlanmaz: Pearson χ² aynı veride p = 0,002 verir.
Kesin p değeri (çift kuyruk): p = 0,005 · Karar: Anlamlı · Sol kuyruk p — P(a ≤ gözlenen): p = 0,003
Büyük tabloda Fisher ile ki-kare örtüşür
100 kişilik tabloda tüm beklenen frekanslar 25,00'tir. Fisher kesin p = 0,071, Pearson χ² p = 0,046 ve Yates düzeltmeli p = 0,072 çıkar; beklenen frekans koşulu sağlandığı için üç yöntem birbirine yakındır. Odds oranı 2,250 (%95 GA: 1,011 – 5,008).
Kesin p değeri (çift kuyruk): p = 0,071 · Karar: Anlamlı değil · Sol kuyruk p — P(a ≤ gözlenen): p = 0,986
Sıfır hücreli tablo
Birinci grupta hiç olay görülmemiş. Kesin p = 0,014 ile fark anlamlıdır; sıfır hücre kesin testi bozmaz. Odds oranı ise tanımsız olacağı için Haldane-Anscombe düzeltmesiyle 0,040 olarak hesaplanır (%95 GA: 0,002 – 0,827).
Kesin p değeri (çift kuyruk): p = 0,014 · Karar: Anlamlı · Sol kuyruk p — P(a ≤ gözlenen): p = 0,007